если коробка, как пишете, раньше кошке нравилась, если она там котят кормила, то, возможно, что дело не только в коробке. но что-то в этой коробке кошку всё-таки раздражает и нервирует: шум, освещённость, запахи.
а если кошка вытаскивает котят, то действительно "разбрасывает" их везде-везде по комнатам? может, она Вашего внимания просит, внимания к ней, а не к котятам?
PS. а котятки - милые